Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Wdhd1-201ENSMUST00000111790 2962 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Tmem252-201ENSMUST00000057243 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms