Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ccdc38Q8CDN8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ccdc38Q8CDN8 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ccdc38Q8CDN8 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ccdc38Q8CDN8 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ccdc38Q8CDN8 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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