Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Atg16l1Q8C0J2 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Atg16l1Q8C0J2 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Atg16l1Q8C0J2 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Atg16l1Q8C0J2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Atg16l1Q8C0J2 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Atg16l1Q8C0J2 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Atg16l1Q8C0J2 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Atg16l1Q8C0J2 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Atg16l1Q8C0J2 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Atg16l1Q8C0J2 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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