Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ccser1Q8C0C4 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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