Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 P2rx7-201ENSMUST00000031425 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Krtap29-1-201ENSMUST00000105051 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Fhl3-202ENSMUST00000106199 1139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Rps28-205ENSMUST00000173844 382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm17250-201ENSMUST00000180494 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Rab38-202ENSMUST00000208478 579 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 AC129590.1-201ENSMUST00000225573 852 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm32540-201ENSMUST00000207174 1872 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Pde7a-203ENSMUST00000121951 382 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm14108-201ENSMUST00000122234 494 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm5951-201ENSMUST00000220283 504 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm8955-201ENSMUST00000182945 1008 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm28381-201ENSMUST00000188403 193 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Olfr1155-201ENSMUST00000099843 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Tbce-201ENSMUST00000039894 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Tph1-202ENSMUST00000107669 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm13861-201ENSMUST00000137136 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm17120-201ENSMUST00000164734 743 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Atp5h-208ENSMUST00000180072 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Gm43965-201ENSMUST00000203779 789 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Pttg1-201ENSMUST00000020685 634 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Cryab-206ENSMUST00000217475 1117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp54Q8BL06 Smim4-201ENSMUST00000049732 311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms