Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm11947-201ENSMUST00000125275 273 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Mir5108-201ENSMUST00000175276 85 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm39481-201ENSMUST00000210379 512 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Rpl14-ps1-201ENSMUST00000026901 653 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm43585-201ENSMUST00000199375 1403 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Siglech-208ENSMUST00000173835 833 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Zfp133-ps-201ENSMUST00000119058 1802 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gpr160-201ENSMUST00000046748 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm44167-201ENSMUST00000204957 1878 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm22481-201ENSMUST00000122562 192 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm23563-201ENSMUST00000174900 251 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm8907-201ENSMUST00000182240 1003 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 AC155293.1-201ENSMUST00000219793 1026 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Rnf183-202ENSMUST00000107454 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Katnal2-203ENSMUST00000123650 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm18471-201ENSMUST00000208272 452 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 AC124484.1-201ENSMUST00000223212 652 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms