Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
NipblQ6KCD5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm31784-201ENSMUST00000209523 1053 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Tmx2-202ENSMUST00000111664 1926 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Serpina1b-201ENSMUST00000095450 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 AC160138.2-201ENSMUST00000220255 1531 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm7910-201ENSMUST00000117896 835 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm3355-201ENSMUST00000160079 487 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Myo1h-209ENSMUST00000199567 1307 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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NipblQ6KCD5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Igsf5-204ENSMUST00000113795 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Stard4-202ENSMUST00000118990 648 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Spaca5-201ENSMUST00000040437 640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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