Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm26356-201ENSMUST00000158217 283 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms