Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm32540-201ENSMUST00000207174 1872 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 1700028P15Rik-203ENSMUST00000151904 519 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 CT025689.5-201ENSMUST00000224316 986 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 AC116390.1-201ENSMUST00000227975 670 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Crygc-201ENSMUST00000027089 783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Olfr649-201ENSMUST00000060440 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 0610037L13Rik-203ENSMUST00000106726 515 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Vegfa-204ENSMUST00000113520 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm14344-201ENSMUST00000139338 580 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm16008-203ENSMUST00000181389 480 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm25426-201ENSMUST00000157606 170 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Sfta2-201ENSMUST00000171166 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm26810-201ENSMUST00000181153 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm44936-201ENSMUST00000207324 735 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 AC140393.4-201ENSMUST00000226994 765 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Vgll3-202ENSMUST00000227997 1383 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Rab7b-201ENSMUST00000064664 1672 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Gm6141-201ENSMUST00000117181 695 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 A730090N16Rik-201ENSMUST00000160137 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc18Q640L5 Ift172-206ENSMUST00000201809 405 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms