Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms