Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Emx2Q04744 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms