Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Thbs2Q03350 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms