Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Garnl3-207ENSMUST00000137381 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Lipa-202ENSMUST00000178114 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Slc2a9-201ENSMUST00000005238 3243 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Smoc1-202ENSMUST00000110347 3496 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 4933415A04Rik-201ENSMUST00000056256 2009 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 C2-205ENSMUST00000148431 1946 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Dclre1c-202ENSMUST00000100463 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Mc1r-201ENSMUST00000098324 3638 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Fbxo11-201ENSMUST00000005504 4019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Apex2-203ENSMUST00000112720 4742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Tcaim-201ENSMUST00000052740 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 AA986860-201ENSMUST00000039323 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Asb3-201ENSMUST00000020551 3228 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Cd101-201ENSMUST00000147399 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Sec23ip-201ENSMUST00000042942 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Ddx5-201ENSMUST00000021062 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Tnfsf15-201ENSMUST00000062246 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm43311-201ENSMUST00000200016 2377 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Vmn1r40-204ENSMUST00000228485 2689 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Olfr209-203ENSMUST00000208875 1194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm16630-201ENSMUST00000180741 3257 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Thsd1-201ENSMUST00000069828 4422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Scmh1-204ENSMUST00000106301 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Tec-202ENSMUST00000073843 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm15601-201ENSMUST00000122972 4033 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 AC121860.1-201ENSMUST00000227908 2787 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm16045-201ENSMUST00000123882 2969 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Pla2g6-210ENSMUST00000174021 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Klf17-201ENSMUST00000062747 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Ankmy1-201ENSMUST00000112998 3243 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Sdr42e1-202ENSMUST00000173522 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Srpx2-202ENSMUST00000113304 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Cbx3-203ENSMUST00000114445 1585 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms