Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Polr1bP70700 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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