Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms