Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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