Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Exosc10-201ENSMUST00000017408 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Rmdn2-201ENSMUST00000040368 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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