Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chd1P40201 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Cct7-203ENSMUST00000204592 1544 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Rab3b-203ENSMUST00000106651 1078 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gm14225-201ENSMUST00000142310 539 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chd1P40201 A530010F05Rik-201ENSMUST00000146845 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gm7693-201ENSMUST00000183257 988 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Tmem265-202ENSMUST00000190278 587 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gm6073-201ENSMUST00000198253 466 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gm18129-201ENSMUST00000208834 1044 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chd1P40201 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Olfr1511-201ENSMUST00000078171 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gm32849-201ENSMUST00000208696 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 n-R5s51-201ENSMUST00000104473 123 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Dnmt3l-ps1-201ENSMUST00000118734 1253 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gm11947-201ENSMUST00000125275 273 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 AC164315.1-202ENSMUST00000226723 657 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Tex43-201ENSMUST00000035640 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 AC151903.1-201ENSMUST00000226677 1423 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Scnn1a-207ENSMUST00000177329 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gm11100-201ENSMUST00000112652 1951 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gm11668-201ENSMUST00000119655 701 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Taz-213ENSMUST00000135504 747 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gm15788-202ENSMUST00000140087 751 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gm17828-201ENSMUST00000183380 799 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Dppa5a-201ENSMUST00000071991 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd1P40201 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Tcl1-201ENSMUST00000041316 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gm10251-202ENSMUST00000181786 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Brd9-206ENSMUST00000222399 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Serpina10-202ENSMUST00000121625 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Trav15-2-dv6-2-201ENSMUST00000103660 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm14654-201ENSMUST00000118620 447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm8832-201ENSMUST00000119890 395 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd1P40201 2410021H03Rik-201ENSMUST00000187090 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd1P40201 1700083H02Rik-201ENSMUST00000190526 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Olfr400-ps1-201ENSMUST00000118094 955 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gstm1-202ENSMUST00000126593 828 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Ly6g6e-202ENSMUST00000172494 464 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Atp5g3-201ENSMUST00000018914 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm37065-202ENSMUST00000192000 568 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm42441-201ENSMUST00000199778 748 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 AC164123.1-201ENSMUST00000213385 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Ang2-201ENSMUST00000051274 438 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms