Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NapbP28663 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NapbP28663 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
NapbP28663 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
NapbP28663 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NapbP28663 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NapbP28663 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NapbP28663 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NapbP28663 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.9 ms