Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Hoxd8P23463 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd8P23463 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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