Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RarbP22605 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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RarbP22605 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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RarbP22605 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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RarbP22605 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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RarbP22605 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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RarbP22605 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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