Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P20040 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P20040 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P20040 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P20040 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
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