Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Nrp2-201ENSMUST00000027112 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ophn1-202ENSMUST00000113826 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Chd8-212ENSMUST00000200169 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Trp63-203ENSMUST00000115304 2634 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 4930470B04Rik-201ENSMUST00000192005 1926 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm42979-201ENSMUST00000196287 2228 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Akap6-202ENSMUST00000219786 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Apex2-203ENSMUST00000112720 4742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm44699-201ENSMUST00000208229 5083 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Unc79-208ENSMUST00000179002 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms