Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Atp10d-202ENSMUST00000126664 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Cep83os-201ENSMUST00000181906 6566 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Dpp4-201ENSMUST00000047812 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Elmo1-201ENSMUST00000072519 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Myt1l-205ENSMUST00000218583 4522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Fkbp15-201ENSMUST00000084527 4264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms