Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XntrpcF8VQM8 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XntrpcF8VQM8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XntrpcF8VQM8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms