Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScaperF8VQ70 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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