Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 5430437J10Rik-202ENSMUST00000227355 634 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Csnk2a1-201ENSMUST00000099224 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Spry4-201ENSMUST00000025295 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm45139-201ENSMUST00000206543 2057 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Ispd-206ENSMUST00000223068 2808 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Myt1l-205ENSMUST00000218583 4522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Tsr2-202ENSMUST00000112683 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm9979-201ENSMUST00000069457 3005 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Dnajc14-201ENSMUST00000026410 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Ash2l-203ENSMUST00000110609 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Dync1i1-201ENSMUST00000115554 2518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Glp2r-201ENSMUST00000021289 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ralgps1-204ENSMUST00000113165 6192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Phf21a-208ENSMUST00000111294 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Pik3c3-203ENSMUST00000115812 3257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Slc7a9-202ENSMUST00000118383 1869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ighg3-202ENSMUST00000223179 2414 ntAPPRIS P5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Mcm10-202ENSMUST00000102985 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 5430416N02Rik-201ENSMUST00000180779 3486 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Slc22a21-201ENSMUST00000076493 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Nedd4l-211ENSMUST00000226058 3393 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Pzp-201ENSMUST00000112132 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm26947-201ENSMUST00000182497 2929 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms