Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Atp8b5A3FIN4 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms