Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms