Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ubl3Q9Z2M6 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ubl3Q9Z2M6 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ubl3Q9Z2M6 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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