Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sema6cQ9WTM3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms