Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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