Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Smg9Q9DB90 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Smg9Q9DB90 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Smg9Q9DB90 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Smg9Q9DB90 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Smg9Q9DB90 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Smg9Q9DB90 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Smg9Q9DB90 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Smg9Q9DB90 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Smg9Q9DB90 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Smg9Q9DB90 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Smg9Q9DB90 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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