Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Use1Q9CQ56 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Use1Q9CQ56 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Use1Q9CQ56 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Use1Q9CQ56 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Use1Q9CQ56 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms