Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms