Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gins4Q99LZ3 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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