Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 2900060N12Rik-201ENSMUST00000221412 3721 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Stk26-201ENSMUST00000033444 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms