Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ubxn4Q8VCH8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ubxn4Q8VCH8 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ubxn4Q8VCH8 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ubxn4Q8VCH8 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms