Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms