Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Usp27Q8CEG8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Usp27Q8CEG8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Usp27Q8CEG8 Fndc7-202ENSMUST00000102620 3477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Usp27Q8CEG8 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Usp27Q8CEG8 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Usp27Q8CEG8 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Usp27Q8CEG8 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Usp27Q8CEG8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Usp27Q8CEG8 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Usp27Q8CEG8 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms