Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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