Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms