Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms