Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
AtminQ6P9S1 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms