Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms