Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 A530010F05Rik-201ENSMUST00000146845 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26974-202ENSMUST00000183263 930 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms