Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rundc1Q0VDN7 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms