Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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