Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Casq2-201ENSMUST00000029454 2556 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Rbmx-201ENSMUST00000098470 3107 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Acad10-201ENSMUST00000031412 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm38215-201ENSMUST00000192321 2233 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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