Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptbP15508 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptbP15508 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptbP15508 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptbP15508 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptbP15508 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptbP15508 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptbP15508 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptbP15508 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptbP15508 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptbP15508 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SptbP15508 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptbP15508 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptbP15508 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptbP15508 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptbP15508 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptbP15508 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptbP15508 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptbP15508 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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SptbP15508 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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SptbP15508 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SptbP15508 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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